性别:女
个人主页:http;//epigenome.duboapp.net
职称:副教授
电子邮件: [email protected]
学历: 博士
导师类型:硕士生导师
学科方向
071010-生物化学与分子生物学
0710Z1-生物信息学

 

研究方向

1. 生物信息及高通量测序方法

2. RNA修饰新方法的建立和调控机制

3. 宏基因组数据挖掘和合成生物学

招聘信息：实验室研究兴趣广泛，鼓励创新，欢迎对科学研究有着强烈兴趣的同学加入。对新入学研究生无背景要求，鼓励学科交叉。同时招聘博士后等青年科研人员，希望具有分子遗传/化学生物/合成生物学，或生物信息学/系统生物学/计算机背景，对方法学创新感兴趣，有探索新方向的志向和能力。

 

个人经历

2022 – 今   赌博app-网络赌博软件 副教授

2020 – 2022 赌博app-网络赌博软件 副研究员

2017 – 2020 赌博app-网络赌博软件 博士后 (合作导师：骆观正教授)

2012 – 2017 赌博app-网络赌博软件 生物化学与分子生物学 理学博士 (导师：施苏华教授)

2008 – 2012 中山大学海洋学院 海洋生物资源与环境 理学学士

 

讲授课程

生命起源与进化（主讲，2023）

生命科学研讨课（参与，2022）

表观遗传学前沿（参与，2022）

 

学术成就

长期以来从事表观转录组学研究，在RNA修饰新方法的建立、基因表达调控和进化分析等方面具有丰富的经验。目前主要从事RNA相关修饰检测方法的开发，及N6甲基腺嘌呤(m6A)修饰的机制与功能研究。成果发表于Nature Methods, Science Advances, National Science Review等期刊，并申请多项发明专利。

主要学术成果：

1. 开发出具有单碱基精度m6A测序新方法m6A-REF-seq，引用超过150次 (Sci. Adv., 2019; Methods, 2021)。

2. 构建体外无修饰RNA文库，系统性地评估和矫正RNA修饰检测方法 (Nat. Methods, 2021)。

 

承担课题

主持

国家自然科学基金面上项目 (2023-2026)

国家自然科学基金 "青年科学基金项目"  (2022-2024)

广东省基础与应用基础研究基金项目 "区域联合基金-青年基金项目" (2020-2022)

中国博士后科学基金 "面上项目" (2019-2020) 已结题

高校基本科研业务费 "青年教师培育项目" 主持  (2019-2021) 已结题

参与

国家自然科学基金 "面上项目"  (2019-2022)

国家重点研发计划-合成生物学青年项目(2022-2027)

国家重点研发计划“前言生物技术”重点专项 (2022-2027)

 

论文专著

代表作

1. Zhang, Z.#, Chen, T.#, Chen, H.X., Xie, Y.Y., Chen, L.Q., Zhao, Y.L., Liu, B.D., ..., and Luo, G.Z.*(2021). Systematic calibration of epitranscriptomic maps using a synthetic modification-free RNA library. Nat. Methods 18, 1213–1222.

2. Zhang, Z., Chen, L.Q., Zhao, Y.L., Yang, C.G., Roundtree, I.A., Zhang, Z., Ren, J., Xie, W., He, C., and Luo, G.Z.* (2019). Single-base mapping of m6A by an antibody-independent method. Sci. Adv. 5, eaax0250.

3. Zhong, Z.D.#, Xie, Y.Y.#, Chen, H.X., Lan, Y.L., Liu, X.H., Ji, J.Y., Wu, F., Jin, L., Chen, J., Mak, DW, Zhang, Z.*, Luo, G.Z.*(2023). Systematic comparison of tools used for m6A mapping from nanopore direct RNA sequencing. Nat. Communications. 14, 1906

4. Chen, L.Q., Zhang, Z., Chen, H.X., Xi, J.F., Liu, X.H., Ma, D.Z., Zhong, Y.H., ..., and Luo, G.Z.* (2022). High-precision mapping reveals rare N6-deoxyadenosine methylation in the mammalian genome. Cell Discov. 8, 1–11.

5. He, Z.#, Xu, S.#, Zhang, Z.#, Guo, W., Lyu, H., Zhong, C., Boufford, D.E., Duke, N.C., and Shi, S.* (2020). Convergent adaptation of the genomes of woody plants at the land-sea interface. Natl. Sci. Rev. 7, 978–993.

6. Chen, H.X., Zhang, Z., Ma, D. Z., Chen, L.Q., and Luo, G.Z.* (2021). Mapping single-nucleotide m6A by m6A-REF-seq. Methods. 10.1016/j.ymeth.2021.06.013

7. Chen, T., Li, Y., Ma, D.Z., Zhang, Z., Xi, J.F., and Luo, G.Z.* (2021). Establishment of transposase-assisted low-input m6A sequencing technique. J. Genet. Genomics 48, 8–11.

8. Xu, S.#, He, Z.#, Zhang, Z.#, Guo, Z., Guo, W., Lyu, H., Li, J., Yang, M., Du, Z., Huang, Y., et al. (2017). The origin, diversification and adaptation of a major mangrove clade (Rhizophoreae) revealed by whole-genome sequencing. Natl. Sci. Rev. 4, 721–734.

9. Xu, S.#, He, Z.#, Guo, Z., Zhang, Z., Wyckoff, G.J., Greenberg, A., Wu, C.I., and Shi, S.*. (2017). Genome-wide convergence during evolution of mangroves from woody plants. Mol. Biol. Evol. 34, 1008–1015.

专利

1. 骆观正; 陈涛; 谢应源; 张璋; 陈鸿萱; 刘标地. 一种混样检测 RNA 修饰并实现精准定量的方法. 发明专利. 专利号：ZL202110844695.1 已授权

2. 骆观正; 陈涛; 李言; 马冬曌; 张璋; 奚剑飞. 一种采用Tn5转座酶辅助构建微量样品m6A修饰检测文库的方法及其应用.  发明专利. 专利号：ZL202110314939.5  已授权

3. 骆观正; 张璋. 一种合成无修饰RNA文库及用来校准RNA修饰检测的方法. 发明专利. 专利号：ZL202011230780.0 已授权

4. 骆观正；陈丽倩；张璋；陈鸿萱. 一种具有单碱基分辨率的核酸修饰检测方法. 发明专利. 专利号：ZL202011034485 .8 已授权