性别: 女
职称: 教授
学历: 博士
电子邮件: [email protected]
导师类型: 博士生导师
学科方向
071007-遗传学
071010-生物化学与分了生物学
0710Z1-生物信息学

 

研究方向

大脑作为复杂的多细胞系统，包含大量不同种类和功能的神经元细胞，这些神经元细胞是大脑功能的基本单元。由同一基因编码的神经元细胞的多样化和个体化的精确调控过程，是表观遗传研究的热点问题。同时，人类的大脑相对于其他物种而言，是各种器官中表型差异最大的器官，也是人类有别于其他生物的独特属性之一。人类智能的演化过程一直以来都是进化生物学中极具吸引力的方向。作为大脑的基本功能单位，神经元细胞的多样化和个体化保证了神经细胞间的正确连接和回路的形成，是大脑复杂功能和高级认知的物质基础。因此探索和解析神经细胞群体间的多样化和个体化的调控机制，以及神经细胞群体多样化在物种间的保守和特异性程度及其在人脑适应性进化过程中的作用等问题，将为理解大脑功能和认识提供细胞和分子基础，为神经系统疾病的预防和治疗提供理论依据。

课题组拟从以下几个方面开展工作，拟招收具有分子生物学、神经生物学、进化生物学、生物信息学、统计学等相关背景硕士和博士研究生， 也欢迎有兴趣的本科生到实验室实习和毕设。

1.以小鼠嗅觉神经元为模型，利用scATACseq、scRNAseq等单细胞组学技术，探索细胞群体表观差异如何调控神经细胞表型的异质性以及靶向连接。

2. 利用比较基因组学和功能基因组学方法，研究大脑复杂功能的分子演化过程。

3. 以功能基因组学方法解析神经系统疾病的分子机理。 

招生计划(2023年）

硕士1名，2023年生物信息学硕士研究生（推免/统考）

优先考虑具有分子进化和群体遗传学背景的硕士研究生。

有兴趣的同学可以通过以下方式联系或申请：  

1.直接发送你的论文和简历到徐老师邮箱（[email protected]）。 

2.直接冲进徐老师办公室(曾宪梓堂北院209)，以会议报告的形式介绍你的工作。

3.悄悄来到徐老师实验室，默默参加实验室工作和活动，引起大家的关注并保证不被赶走。 

招聘信息（博士后，长期）

招聘要求：

1. 在国内外已获得或即将获得博士学位，具有以下任一相关研究经验：

a. 进化生物学、群体遗传学方向。

b. 分子生物学方向：分子生物学、表观遗传学相关研究背景者；具有染色质结构、染色质修饰、单等位基因表达相关研究背景者；

熟悉二代测序文库、单细胞测序文库建立；熟悉流式细胞分选技术。

c.神经生物学方向：具有神经生物学研究背景；熟悉神经细胞分离、培养、体外定向分化；熟悉模式动物操作。

2.  具备良好的学术道德、沟通能力和团队合作精神。

3.  获得博士学位3年以内，年龄不超过35周岁。

4. 博士后在站期限为3年，因项目进展需要可申请至4年。优秀者在聘期结束后可应聘学校副教授职位。

岗位待遇：

1. 基本工资年薪20万（税前），单位提供五险一金

2. 学校提供校内博士后公寓，按规定缴纳租金。

3. 为子女就读中山大学附属学校提供便利。

4.协助申请广东省各类博士后人才项目。

更多说明请参见中山大学博后申请说明：

  //rsc.duboapp.net/postdoctor/article/91

 

个人经历

2019-至今 赌博app-网络赌博软件 ，教授

2014-2019 斯坦福大学医学院，博士后（导师： Howard Y. Chang)

2008-2014 中科院北京基因组研究，生物信息学，博士（导师: Chung-I Wu）

2003-2007  东北师范大学， 软件工程，学士

 

讲授课程

专业必修课-大学生物（下）

专业必修课-生命科学引论

专业选修课--生物安全

公共选修课--数据分析实战

 

学术成就

徐锦，中山大学2019“百人计划”引进人才，赌博app 教授。主要研究方向为基因表达在演化、发育和疾病中的调控机制。以计算生物学和基因组学为手段，研究和探索了包含表观遗传学修饰、转录调控和转录后调控等多个层次的调控机制。目前已在Cell, Nature Genetics, Neuron, eLife 等国际专业学术期刊发表多篇论文。

 

承担课题

解析小鼠嗅觉神经细胞中随机单等位表达调控元件及其调控机制，主持，国家级，2021-01--2024-12

神经退行性疾病的生物标志物研究，参与，省级，2020-01--2023-12

基于deconvolution算法的神经细胞特异性表达分析软件开发，主持，省级，2020-01--2022-12

中山大学“百人计划”启动项目（2019-2020）

国家级人才计划（2019-2021）

 

论文专著

主要工作：

  • Zhongjie Tang, Zhaolian Lu, Baizhen Chen, Weixing Zhang, Howard Y. Chang, Zheng Hu and Jin Xu  A Genetic Bottleneck of Mitochondiral DNA during Human Lymphocyte Development Mol.Biol.Evol. 2022 May; 39(5) 

 

  • Yixin Zhao ,Guang-An Lu, Hao Yang, Pei Lin, Zhongqi Liufu, Tian Tang, and Jin Xu# Run or Die in the Evolution of New MicroRNAs—Testing the Red Queen Hypothesis on De Novo New Genes. Mol. Biol. Evol. 2021

 

  • Xu, Jin; Nuno, Kevin; Litzenburger, Ulrike M; Qi, Yanyan; Corces, M Ryan; Majeti, Ravindra; Chang, Howard Y.  Single-cell lineage tracing by endogenous mutations enriched in transposase accessible mitochondrial DNA.  eLife , 2019

 

  • Cho, Seung Woo*; Xu, Jin*; Sun, Ruping; Mumbach, Maxwell R; Carter, Ava C; Chen, Y Grace; Yost, Kathryn E; Kim, Jeewon; He, Jing; Nevins, Stephanie A; et.al Promoter of lncRNA Gene PVT1 Is a Tumor-Suppressor DNA Boundary Element.  Cell,2018 

  • Xu, Jin*; Peng, Xinxin*; Chen, Yuxin; Zhang*, Yuezheng; Ma, Qin; Liang, Liang; Carter, Ava C; Lu, Xuemei; Wu, Chung-I.  Free-living human cells reconfigure their chromosomes in the evolution back to uni-cellularity.  eLife,2017

  • Xu, Jin*; Carter, Ava C*; Gendrel, Anne-Valerie; Attia, Mikael; Loftus, Joshua; Greenleaf, William J; Tibshirani, Robert; Heard, Edith; Chang, Howard Y.   Landscape of monoallelic DNA accessibility in mouse embryonic stem cells and neural progenitor cells .   Nature Genetics, 2017

  • Huang, Wei-Hsiang*; Guenthner, Casey J*; Xu, Jin*; Nguyen, Tiffany; Schwarz, Lindsay A; Wilkinson, Alex W; Gozani, Or; Chang, Howard Y; Shamloo, Mehrdad; Luo, Liqun.  Molecular and Neural Functions of Rai1, the Causal Gene for Smith-Magenis Syndrome.   Neuron, 2016

  • Giorgetti, Luca; Lajoie, Bryan R; Carter, Ava C; Attia, Mikael; Zhan, Ye; Xu, Jin; Chen, Chong Jian; Kaplan, Noam; Chang, Howard Y; Heard, Edith.  Structural organization of the inactive X chromosome in the mouse.  Nature 2016 

  • Xu, Jin*; Zhang, Rui*; Shen, Yang; Liu, Guojing; Lu, Xuemei; Wu, Chung-I.  The evolution of evolvability in microRNA target sites in vertebrates.  Genome Research, 2013

更多发表文章请见：

//scholar.google.com/citations?hl=en&user=AbwsBU4AAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate