性别:女
工作电话:84112517
职称:副教授
电子邮件: [email protected]
导师类型: 博士生导师
学历: 博士
学科方向
071010-生物化学与分子生物学
0710Z1-生物信息学
0860-生物与医药
研究方向
功能基因组学与生物信息学
非编码RNA调控网络与重大疾病
高通量测序数据分析与应用
病原体-宿主之间的相互作用网络
合成生物学（核酸治疗）
机器学习/深度学习算法开发
个人经历
2021.11-至今 中山大学生物工程研究中心 副职
2021.10-至今 赌博app-网络赌博软件
三全育人创新中心 主任
2019.10-至今 中山大学青年教师专职辅导员
2017.01-2020.10 中山大学生物工程中心党支部书记
2017.01-至今 赌博app-网络赌博软件
副教授
2012.07-2016.12 赌博app-网络赌博软件
讲师
2009.09-2012.06 赌博app-网络赌博软件
生物化学与分子生物学 博士（导师屈良鹄教授）
2006.09-2009.06 赌博app-网络赌博软件
信息生物学 硕士（导师王珣章教授）
2002.09-2006.06 东北林业大学 计算机系 本科
讲授课程
《细胞生物学实验》（国家精品课程）、《基因组学》、《计算机在生物工程中的应用》、《计算机程序设计语言》
2014.2016两年本科生评教全校排名第一
2018年获全国高校（生命科学类）微课教学比赛一等奖、教学风采奖
2018年获广东省青年教师授课大赛理工组二等奖
2018年获中山大学青年教师授课大赛理工组二等奖
2015年获全国高校（生命科学类）微课教学比赛一等奖、教学风采奖
2017年6月获中山大学青年教师授课大赛理工组二等奖
2014年获中山大学温氏杰出青年奖教金
2013-2015年获IGEM(国际基因工程机器设计大赛) 最佳软件项目奖（Best Software Project）及金奖（Gold）
学术成就
长期致力于利用计算生物学方法研究非编码RNA的功能及其在重大疾病中作用的研究，在国际杂志上发表论文23篇，其中1篇文章受到Science编辑点评，1篇文章入选ESI高被引论文。目前主要采用多维高通量组学技术研究病原生物-宿主之间的相互作用网络。建立了全面的非编码RNA数据库tModBase、deepBase 2.0，dreamBase，ColorCells, exomiR-Explorer等，并开发了专门从高通量测序数据中挖掘tRNA Fragment的工具。代表性成果发表在NAR、PNAS、Briefings in bioinformatics等多个专业领域杂志上。获得多项国家自然科学基金的资助，包括青年基金、面上项目等，同时还获得了 “广州市珠江科技新星”项目资助。担任中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员，以及中国生物化学与分子生物学会核糖核酸专业青年委员会委员，多次受邀在重要国内学术会议上进行大会报告，并获得“第十届全国核糖核酸（RNA）学术讨论会”优秀青年学术报告奖。受邀担任担Biomolecules期刊的组稿编辑，建设“ Single Cell RNA Sequencing Approaches in Immunology ”特邀专刊，并担任NAR，BMC Biology，Science China Life Science 等杂志的审稿人，主笔撰写《RNA 研究中的重大科学问题-学科发展战略系列研究报告》、《非编码基因生物学研究进展（生物化学与分子生物学学科发展报告）》等。
承担课题
主持项目：
国家自然科学基金、原生生物miRNA的系统鉴定与起源分析、郑凌伶（25万）
国家自然科学基金、tRNA衍生的小RNA在癌症中的表达及其介导的调控网络研究、郑凌伶（65万）
国家自然科学基金、病毒感染引发tsRNA生成的分子机制及其介导的调控网络研究、郑凌伶（55万）
广州市科技计划、基于高通量测序数据研究寄生虫非编码基因的种类、特征及功能、郑凌伶（30万）
广东省科技计划、tsRNA作为肝细胞癌早期诊断及预后的新型分子指标研究、郑凌伶（10万）
广东省科技计划、基于长非编码RNA的细胞分类模型及功能网络研究（10万）
国家重点实验室、SARS-CoV-2病毒感染引起的宿主转录组及小RNA组特异性分子筛查研究（10万）
中山大学青年教师培育项目、基于双重RNA-seq方法构建寄生虫-宿主互作调控网络、郑凌伶（10万）
参与项目：
国家重点研发计划、表观转录组及 RNA 大分子互作筛选技术、徐迅（2000万）
国家重点研发计划、新型长链非编码RNA(lncRNA)-蛋白质机器介导的表观 、陈月琴（934万）
国家自然科学基金、Wnt/β-catenin信号通路中microRNA的表达调控及功能研究、屈良鹄（299万）
国家自然科学基金、自然和人工诱导布氏锥虫分化的分子机理 、伦照荣（89万）
国家自然科学基金、基于机器学习的生物医学大数据挖掘理论与方法研究 、戴道清 （450万）
国家自然科学基金、植物生殖发育相关的长链非编码RNA功能与调控机制 、陈月琴（290万）
广州市科技计划项目、非编码RNA基因资源的发掘与利用 、屈良鹄（165万）
广州市科技计划项目、microRNA及其靶向的蓝铜蛋白调控水稻产量的作用机制和应用研究 、陈月琴（165万）
珠海市科技计划项目、基于双转录组分析技术筛选新型冠状病毒感染的特异性分子标志物及其功能 研究（7万）
论文专著
期刊论文：
Sun Y, Huang ZL, Chen WX, Zhang YF, Lei HT, Huang QJ, Lun ZR, Qu LH*, Zheng LL*. GateView: A Multi-Omics Platform for Gene Feature Analysis of Virus Receptors within Human Normal Tissues and Tumors. Biomolecules. 2024 Apr 25;14(5):516. doi: 10.3390/biom14050516. PMID: 38785923; PMCID: PMC11118183.
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Liu X, Wen YZ, Huang ZL, Shen X, Wang JH, Luo YH, Chen WX, Lun ZR, Li HB, Qu LH*, Shan H*, Zheng LL*. SARS-CoV-2 causes a significant stress response mediated by small RNAs in the blood of COVID-19 patients. Mol Ther Nucleic Acids. 2022 Mar 8;27:751-762. doi: 10.1016/j.omtn.2021.12.034. PMID: 35003892; PMCID: PMC8719421.（Elsevier认证关联联合国可持续发展目标3）
Huang Z, Xia S, Mei S, Wen Y, Liu J, Dong C, Chen W, Yu P, Qu L, Luo Y*, Zheng L*. Integrated Analysis Reveals the Characteristics and Effects of SARS-CoV-2Maternal-Fetal Transmission. Front Microbiol. 2022 Jan 27;13:813187. doi:10.3389/fmicb.2022.813187. PMID: 35154056; PMCID: PMC8828581.
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Bo-Wei Han, Dan-Dan Feng, Zhi-Gang Li2, Xue-Qun Luo, Hua Zhang, Xiao-Juan Li, Xing-Ju Zhang, Ling-Ling Zheng, Cheng-Wu Zeng, Kang-Yu Lin, Peng Zhang, Ling Xu and Yue-Qin Chen. A set of miRNAs that involve in the pathways ofdrug resistance and leukemic stem-cell differentiation is associated with therisk of relapse and glucocorticoid response in childhood ALL. Hum Mol Genet. 2011Dec 15;20(24):4903-15.
主要论著
Ling-Ling Zheng, Jian-You Liao, Yan-Zi Wen, Geoff Hide*, Liang-Hu Qu* and Zhao-Rong Lun*.Different Types of Small RNAs in Protozoa. Springer.2016.(ISBN: 978-3-319-39494-7).
会议论文：
Ling-Ling Zheng and Liang-Hu Qu. High-throughput analysis of small RNAs reveals the existence and dramatic changes of ncRNAs during differentTrypanosoma brucei developmentally regulation stages. 2010, The Sixth National Symposium on Ribonucleic Acid (RNA), Guangzhou, China
郑凌伶，屈良鹄 计算RNA组学分析平台在真核生物非编码RNA及比较转录组学研究中的应用.2012，The Seventh National Symposium on Ribonucleic Acid (RNA), Chengdu, China
专利：
发 明 人： 郑凌伶;黄巧娟;屈良鹄;杨建华，一种大规模单细胞分型方法、系统及存储介质。专利号：ZL202110118686.4，授权公告日：2023年08月22日，授权公告号：CN112908414B
