研究方向
遗传与进化
体细胞高突变与体细胞演化
1. 细胞谱系追踪技术的开发与应用；
已完成技术的开发，可实现记录每一次细胞分裂事件的超高分辨率，并通过整合单细胞转录组技术，同步捕获细胞的谱系信息和细胞的功能信息，从多个维度理解多细胞生物发育的过程。当前的技术攻关在于整合空间转录组技术，从而整合“细胞位置-细胞功能-细胞谱系”全方位的信息，进而理解发育过程的细胞命运决定机制。
2. 体细胞高突变技术的开发与应用。
以单碱基突变作为基本操作单元，借助于多种前沿生物技术（例如基因编辑），开发体细胞高突变技术。针对一个目标基因乃至多个靶基因，进行饱和式突变，穷尽遗传多样性的所有可能，充分挖掘一个基因的所有潜能。
博士生和硕士生招生简介：
2024年实验室硕士、博士招生方向为生物化学与分子生物学，生物信息学。
欢迎感兴趣的同学发邮件联系 [email protected]。
实验室长期招聘博士后（2024年起），博士后应聘条件：
1）植物学、细胞生物学、分子生物学、生物信息学相关专业领域已毕业博士或即将毕业的博士在读生；
2）撰写的研究论文已在高水平国际学术期刊发表或接收发表者优先考虑；
3）有NGS测序数据分析经验优先考虑；
4）有合成生物学、基因编辑和作物育种相关研究经历优先考虑。
个人经历
2010-2014, 中山大学，赌博app ，理学学士
2014-2020, 中山大学，赌博app ，理学博士
2022-2024, 中山大学，赌博app ，博士后
2024-至今，中山大学，赌博app ，助理教授
学术成就
近5年，以第一/共同第一作者在高水平国际主流期刊 Nature Methods (2021)、Nature Plants (2023) 发表研究论文2篇。博士阶段经过长期的攻坚努力，以单碱基突变为谱系信息记录载体，开发了超高分辨率的细胞谱系追踪技术——substitution mutation-aided lineage-tracing (SMALT) ，可实现细胞每分裂1次平均积累1个单碱基突变的超高分辨率，并记录了多细胞生物黑腹果蝇的发育历史，还原了各器官发育过程细胞的群体动态变化和分裂模式。博士后阶段，通过构架创新，以gRNA为分子胶，将单碱基编辑的核心组分进行优化重组并拆分，开发了简单、安全且通用的消除基因编辑脱靶风险的技术——split deaminase for safe editing (SAFE)，一举消除了多个层面的脱靶编辑，实现更加安全的基因编辑。
承担课题
1. 中山大学高层次引进人才计划，中山大学， 主持，在研（100万）。
2. 国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目，32200494，中山大学，主持，在研（30万）。
3. 中国博士后科学基金会，面上资助项目，2022M723662，中山大学，主持，结题（8万）。
4. 高校基本科研业务费，一般项目，23ptpy56，中山大学，主持，结题（5万）。
论文专著
1. Liu Kehui#; Deng Shanjun#; Ye Chang#; Yao Zeqi; Wang Jianguo; Gong Han; Liu Li*; He Xionglei*. Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development. Nature Methods 18, 1506–1514 (2021). //doi.org/10.1038/s41592-021-01325-x (共同一作)
2. Xiong Xiangyu#; Liu Kehui#*; Li Zhenxiang; Xia Fan-Nv; Ruan Xue-Ming; He Xionglei; Li Jian-Feng*. Split complementation of base editors to minimize off-target edits. Nature Plants 9, 1832–1847 (2023). //doi.org/10.1038/s41477-023-01540-8 (共同一作，共同通讯)
3. Yao Zeqi#; Kehui Liu#; Deng Shanjun; He Xionglei*. An instantaneous coalescent method insensitive to population structure. Journal of Genetics and Genomics. 2021, 48(3): 219-224. //doi.org/10.1016/j.jgg.2021.03.005 (共同一作)
