研究方向
各种自然/构建环境的——微生物组学与合成生物学
1. 极端/特殊生态系统微生物资源与生态（时空分布格局、培养方法新技术、新数据集合——生态学、生物信息学背景——团队有一手、独特的可观数据供分析）
2. 微生物-植物/宿主互作机制（核心微生物群及功能验证——微生物学、分子生物学（酶工程、遗传操作体系）背景——团队有独特的稀缺菌株资源供挖掘）
3. 微生物资源的应用场景评价及转化（工业、农业、医药领域——化学生物学、有机化学（天然产物、分析化学）、药学、材料科学——团队有完善的开发平台，丰富的产学研方向）
招生/招聘信息：
实验室研究面广泛，平台完善，特别注重理论研究和应用实践（产学研），欢迎对科学研究有强烈兴趣，具有学科交叉，“干湿”结合研究理念的青年在我们这里施展你的才华。
长期招聘博士后、科研助理等青年科研人员，具备有机化学、化学生物学、合成生物学，或生物信息学、计算机（Python/C++/R/Perl）等学科背景，有较高的科学素养、动手能力，乐于创建新方法体系。
个人经历
2024 – 今 中山大学 赌博app 副教授
2019 – 2021 中山大学 赌博app 博士后 (合作导师：苏薇薇 教授，李文均 教授)； 2021 – 2023 中山大学 赌博app 特聘副研究员；
2014 – 2019 中国科学院 上海有机化学研究所 联合培养硕士/博士 （合作导师：唐功利 研究员）
2013 – 2016 云南大学 赌博app 工学硕士 (导师：李文均 教授)；2016 – 2019 中山大学 赌博app 理学博士 (导师：李文均 教授)
2008 – 2012 云南大学 赌博app 理学学士； 2011 – 2012 中国中医科学院 药物研究所 本科毕业设计
学术成就
以通讯作者或第一作者（含共同）在Science of The Total Environment、Organic Letters、npj Biofilms and Microbiomes、Applied Soil Ecology、Environmental Microbiomes、International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology等国际权威SCI期刊发表论文40余篇。
担任Advanced Biotechnology、iMeta、 生物多样性 等期刊青年编委，担任Nature Communications、iMeta、Global Ecology and Conservation、International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology、Antonie van Leeuwenhoek 等期刊审稿人。
承担课题
主持
国家自然科学基金 面上项目 (2023-2026)
中国科学技术部 第三次新疆综合科学考察 项目子课题（2022-2025）
国家自然科学基金 青年科学基金项目 (2021-2023)
广东省湿症重点实验室 开放课题项目 （2020-2022）
高校基本科研业务费 青年教师培育项目 (2019-2021)
参与（骨干）
广东省重点研发专项项目 （2022-2025）
国家自然科学基金 国际（地区）合作与交流项目 (2021-2023)
国家重大研究计划重点项目 (2020-2023)
国家自然科学基金 面上项目 (2020-2023)
广东省重点研发专项项目 （2018-2021）
论文专著
部分通讯作者及第一作者论文：
一、勘探—极端/特殊生境微生物多样性
1）基于大规模系统性采样，首次系统揭示我国荒漠生态系统中微生物多样性地理分布格局及群落构建机制
Lei Dong, Mei-Xiang Li, Shuai Li, Ling-Xiang Yue, Mukhtiar Ali, Jia-Rui Han, Wen-Hui Lian, Chao-Jian Hu, Zhi-Liang Lin, Guo-Yuan Shi, Pan-Deng Wang, Shao-Ming Gao, Zheng-Han Lian, Ting-Ting She, Qi-Chuang Wei, Qi-Qi Deng, Qian Hu, Jia-Liang Xiong, Yong-Hong Liu, Li Li, Osama Abdalla Abdelshafy, Wen-Jun Li*. Aridity drives the variability of desert soil microbiomes across north-western China. Science of the Total Environment, 2024, 907: 168048.
中山大学新闻网：//www.duboapp.net/news/info/2331/1070651.htm；
学院新闻动态：//duboapp.net/zh-hans/article/82;
原文链接：//doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.168048。
2）沙漠农场根际微生物群落结构与生态功能研究，验证“土脉-菌脉”等微生态理论，为干旱区生境农用菌剂研发提供新见解
A. Wen-Hui Lian（连文慧，2021级博士生）#, Osama Abdalla Abdelshafy Mohamad（Osama博士，2023年获中国政府友谊奖)#, Lei Dong#, Ling-Yu Zhang, Dong Wang, Lan Liu, Ming-Xian Han, Shuai Li, Shuang Wang, André Antunes, Bao-Zhu Fang, Jian-Yu Jiao* and Wen-Jun Li*. Culturomics- and metagenomics-based insights into the microbial community and function of rhizosphere soils in Sinai desert farming systems. Environmental Microbiome, Environmental Microbiome, 2023, 18(1): 4.
中山大学新闻动态：//www.duboapp.net/info/2121/29702.htm；
原文链接：//doi.org/10.1186/s40793-023-00463-3。
B. Wen-Hui Lian（连文慧，2021级博士生）, Mei-Xiang Li, Ling-Xiang Yue, Shuai Li, Zhi-Liang Lin, Chao-Jian Hu, Jia-Rui Han, Wen-Jun Li*, Lei Dong*. Agricultural management reshaped the diversity patterns and community assembly of rhizosphere bacterial communities in a desert farming system. Applied Soil Ecology, 2024, 203:105656.
原文链接：//doi.org/10.1016/j.apsoil.2024.105656。
二、保护—极端/特殊生境微生物多样性
3）利用基于培养组的宏基因组学和高分辨分析捕获极端干旱沙漠土壤微生物暗物质，为各种特殊生境微生物暗物质的勘探和保护提供可靠有效的新策略、新思路
Shuai Li（李帅，2022博士后）, Wen-Hui Lian, Jia-Rui Han, Mukhtiar Ali, Zhi-Liang Lin, Yong-Hong Liu, Li Li, Dong-Ya Zhang, Xian-Zhi Jiang, Wen-Jun Li* and Lei Dong*. Capturing the microbial dark matter in desert soils using culturomics-based metagenomics and high-resolution analysis. npj Biofilms and Microbiomes, 2023, 9(1):67.
中山大学新闻网：//www.duboapp.net/news/info/2331/1068461.htm； 学院新闻动态：//duboapp.net/news/5840；
科学网：//news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/509614.shtm； 宏基因组宣传网页：//mp.weixin.qq.com/s/-EeLxHS9lj8zpWFMLUaJnQ；
基金委宣传网页：//www.nsfc.gov.cn/csc/20340/20343/65915/index.html；
Nature Portfolio Microbiology Community：//microbiologycommunity.nature.com/posts/culturomics-based-metagenomics-cbm-a-powerful-approach-for-mining-microbial-dark-matter-resources-hidden-in-unexplored-habitats；
原文链接：//www.nature.com/articles/s41522-023-00439-8。
4）通过系统对比分析高通量测序（免培养）与传统纯培养方法在微生物多样性研究中的差异性，建议在未来的多样性研究中，同时采用“免培养+纯培养”，两者互为补充，提升研究可靠性，本研究的亮点是构建了极端干旱沙漠生境链霉菌的高效分离、培养方法，积累了宝贵的极端链霉菌资源
Shuai Li（李帅，2018级博士生）#, Lei Dong#,*, Wen-Hui Lian, Zhi-Liang Lin, Chun-Yan Lu, Lu Xu, Li Li, Wael N. Hozzein, Wen-Jun Li*. Exploring untapped potential of Streptomyces spp. in Gurbantunggut Desert by use of highly selective culture strategy. Science of the Total Environment, 2021, 790: 148235.
中山大学新闻动态：//www.duboapp.net/news/info/2331/1063861.htm；
学院新闻动态：//duboapp.net/zh-hans/article/2338；
原文链接：//www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969721033064。
三、应用—极端/特殊生境微生物多样性
5）极端环境，如极度干旱沙漠、海洋、盐湖、热泉等中蕴藏着丰富多样的极端微生物。其中包含众多未被发现的微生物，被称为“微生物暗物质”。该文章总结了极端微生物的研究发展现状，提出了多组学大数据指导下的极端微生物资源高效发现，进而深入挖掘应用微生物代谢潜能的理性实施技术路径，助力合成微生物学与生物制造的蓬勃发展。
Jia-Rui Han (韩嘉瑞，2024级博士生）, Shuai Li, Wen-Jun Li*, Lei Dong*. Mining Microbial and Metabolic Dark Matter in Extreme Environments: A Roadmap for Harnessing the Power of Multi-omics Data. Advanced Biotechnology, 2024, 2,26.
文章解读：//mp.weixin.qq.com/s/aQaGSYLNqsra6PJCwlaD8w
原文链接：//doi.org/10.1007/s44307-024-00034-8
6）二甲双胍(metformin)是II型糖尿病的一线治疗药物，作为一种新污染物，二甲双胍(metformin)及其生物转化产物guanylurea随人们生活进入到水体，在水生环境中对水生生物产生一定的毒性作用，本文综述了二甲双胍及guanylurea的全球分布，并提出了可增强其降解的微生物策略，为其日后的治理工作提供新思路
Lei Dong, Shuai Li, Jie Huang, Wen-Jun Li*, Mukhtiar Ali*. Co-occurrence, toxicity, and biodegradation mechanisms of pharmaceuticals: Current state and future prospects for enhanced biodegradation strategy. Science of the Total Environment, 2024, 921: 171108.
学院新闻动态：//duboapp.net/zh-hans/article/4589
原文链接：//doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.171108。
7）基于抗肿瘤聚酮化合物LL-D49194α1的生物合成机制研究，首次鉴定并阐明了其生物合成基因簇及后修饰通路，明确了两个成药性表现极佳的新颖先导化合物，可用于进一步临床新药研发
Lei Dong, Yi Shen, Xian-Feng Hou, Wen-Jun Li* and Gong-Li Tang*. Discovery of Druggability-Improved Analogues by Investigation of LL-D49194α1 Biosynthetic Pathway. Organic Letters, 2019, 21(7): 2322-2325.
学院新闻动态：//duboapp.net/zh-hans/article/1472；
原文链接：//doi.org/10.1021/acs.orglett.9b00610。
